Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ush1cQ9ES64 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ush1cQ9ES64 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ush1cQ9ES64 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms