Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI2

Rab27a, Ras-related protein Rab-27A, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27aQ9ERI2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab27aQ9ERI2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab27aQ9ERI2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab27aQ9ERI2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab27aQ9ERI2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab27aQ9ERI2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab27aQ9ERI2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab27aQ9ERI2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab27aQ9ERI2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab27aQ9ERI2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab27aQ9ERI2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms