Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Irx6Q9ER75 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Irx6Q9ER75 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Irx6Q9ER75 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx6Q9ER75 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms