Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Clstn2Q9ER65 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clstn2Q9ER65 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn2Q9ER65 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms