Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Scn4aQ9ER60 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Scn4aQ9ER60 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Scn4aQ9ER60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Scn4aQ9ER60 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Scn4aQ9ER60 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Scn4aQ9ER60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Scn4aQ9ER60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Scn4aQ9ER60 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Scn4aQ9ER60 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Scn4aQ9ER60 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scn4aQ9ER60 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Scn4aQ9ER60 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms