Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kcnn1Q9EQR3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kcnn1Q9EQR3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kcnn1Q9EQR3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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