Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr1Q9EPQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr1Q9EPQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr1Q9EPQ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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