Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpr88Q9EPB7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr88Q9EPB7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr88Q9EPB7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr88Q9EPB7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr88Q9EPB7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr88Q9EPB7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr88Q9EPB7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr88Q9EPB7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr88Q9EPB7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr88Q9EPB7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr88Q9EPB7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms