Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubiad1Q9DC60 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubiad1Q9DC60 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubiad1Q9DC60 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubiad1Q9DC60 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubiad1Q9DC60 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms