Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB54

Fam216a, Protein FAM216A, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam216aQ9DB54 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam216aQ9DB54 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam216aQ9DB54 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam216aQ9DB54 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam216aQ9DB54 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam216aQ9DB54 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam216aQ9DB54 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam216aQ9DB54 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam216aQ9DB54 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam216aQ9DB54 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam216aQ9DB54 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam216aQ9DB54 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam216aQ9DB54 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms