Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf4Q9DAW6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4Q9DAW6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms