Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf654Q9DAU9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf654Q9DAU9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf654Q9DAU9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf654Q9DAU9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms