Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA04

Tmem89, Transmembrane protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem89Q9DA04 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem89Q9DA04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem89Q9DA04 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem89Q9DA04 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem89Q9DA04 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem89Q9DA04 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem89Q9DA04 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem89Q9DA04 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem89Q9DA04 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem89Q9DA04 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem89Q9DA04 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem89Q9DA04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem89Q9DA04 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem89Q9DA04 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem89Q9DA04 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem89Q9DA04 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem89Q9DA04 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.5 ms