Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl17Q9D8P4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms