Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl4Q9D8E6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpl4Q9D8E6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl4Q9D8E6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms