Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MsraQ9D6Y7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MsraQ9D6Y7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MsraQ9D6Y7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
MsraQ9D6Y7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms