Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdr42e1Q9D665 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdr42e1Q9D665 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms