Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab11fip1Q9D620 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab11fip1Q9D620 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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