Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd2Q9D5U8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd2Q9D5U8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnbd2Q9D5U8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms