Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata1Q9D5R4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Spata1Q9D5R4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spata1Q9D5R4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms