Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3a3Q9D554 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3a3Q9D554 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms