Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf1dQ9D4V4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Taf1dQ9D4V4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Taf1dQ9D4V4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Taf1dQ9D4V4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Taf1dQ9D4V4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms