Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R8

Mrps33, 28S ribosomal protein S33, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps33Q9D2R8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps33Q9D2R8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps33Q9D2R8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrps33Q9D2R8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms