Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl28Q9D1B9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms