Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms