Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ist1Q9CX00 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ist1Q9CX00 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ist1Q9CX00 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms