Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otub2Q9CQX0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Otub2Q9CQX0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otub2Q9CQX0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otub2Q9CQX0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otub2Q9CQX0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otub2Q9CQX0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otub2Q9CQX0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otub2Q9CQX0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otub2Q9CQX0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otub2Q9CQX0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otub2Q9CQX0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otub2Q9CQX0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms