Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc198Q9CPZ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc198Q9CPZ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc198Q9CPZ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms