Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cntnap2Q9CPW0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntnap2Q9CPW0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap2Q9CPW0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap2Q9CPW0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cntnap2Q9CPW0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntnap2Q9CPW0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntnap2Q9CPW0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms