Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT1

Arhgdia, Rho GDP-dissociation inhibitor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArhgdiaQ99PT1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ArhgdiaQ99PT1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArhgdiaQ99PT1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArhgdiaQ99PT1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ArhgdiaQ99PT1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms