Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rrbp1Q99PL5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rrbp1Q99PL5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rrbp1Q99PL5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rrbp1Q99PL5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rrbp1Q99PL5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms