Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms