Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird2Q99NI3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms