Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lysmd3Q99LE3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lysmd3Q99LE3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lysmd3Q99LE3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms