Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gps1Q99LD4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gps1Q99LD4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gps1Q99LD4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms