Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TriobpQ99KW3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TriobpQ99KW3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TriobpQ99KW3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms