Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcoln1Q99J21 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln1Q99J21 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcoln1Q99J21 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms