Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg13Q91YI1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg13Q91YI1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg13Q91YI1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg13Q91YI1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms