Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chrna2Q91X60 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chrna2Q91X60 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna2Q91X60 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chrna2Q91X60 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.3 ms