Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q91WD4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q91WD4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q91WD4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q91WD4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q91WD4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q91WD4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q91WD4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q91WD4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q91WD4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q91WD4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q91WD4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q91WD4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q91WD4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q91WD4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q91WD4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q91WD4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Q91WD4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q91WD4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q91WD4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q91WD4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q91WD4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Q91WD4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Q91WD4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q91WD4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q91WD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q91WD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Q91WD4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q91WD4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q91WD4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q91WD4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q91WD4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q91WD4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q91WD4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q91WD4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q91WD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q91WD4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Q91WD4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q91WD4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q91WD4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q91WD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q91WD4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q91WD4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q91WD4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q91WD4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q91WD4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Q91WD4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q91WD4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q91WD4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q91WD4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q91WD4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q91WD4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Q91WD4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q91WD4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q91WD4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q91WD4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q91WD4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q91WD4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q91WD4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q91WD4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q91WD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q91WD4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q91WD4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q91WD4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q91WD4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q91WD4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Q91WD4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q91WD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q91WD4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q91WD4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q91WD4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q91WD4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q91WD4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q91WD4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q91WD4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q91WD4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q91WD4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q91WD4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q91WD4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q91WD4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q91WD4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q91WD4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q91WD4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q91WD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q91WD4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q91WD4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q91WD4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q91WD4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q91WD4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q91WD4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q91WD4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q91WD4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q91WD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q91WD4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q91WD4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q91WD4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q91WD4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q91WD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q91WD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q91WD4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms