Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Setd3Q91WC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setd3Q91WC0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd3Q91WC0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd3Q91WC0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms