Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp3Q91W36 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp3Q91W36 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp3Q91W36 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms