Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgbl1Q8VDV0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgbl1Q8VDV0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgbl1Q8VDV0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgbl1Q8VDV0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgbl1Q8VDV0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgbl1Q8VDV0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgbl1Q8VDV0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgbl1Q8VDV0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgbl1Q8VDV0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgbl1Q8VDV0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgbl1Q8VDV0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgbl1Q8VDV0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms