Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDI1

Epsti1, Epithelial-stromal interaction protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epsti1Q8VDI1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epsti1Q8VDI1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epsti1Q8VDI1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epsti1Q8VDI1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epsti1Q8VDI1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms