Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slf1Q8R3P9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf1Q8R3P9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf1Q8R3P9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms