Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rassf9Q8K342 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rassf9Q8K342 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rassf9Q8K342 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rassf9Q8K342 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms