Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacs1Q8K212 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacs1Q8K212 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacs1Q8K212 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs1Q8K212 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacs1Q8K212 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacs1Q8K212 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacs1Q8K212 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms