Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34c1Q8K193 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Cldn34c1Q8K193 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Cldn34c1Q8K193 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c1Q8K193 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c1Q8K193 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms