Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrit1Q8K099 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrit1Q8K099 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrit1Q8K099 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrit1Q8K099 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrit1Q8K099 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms