Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nupl2Q8CIC2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nupl2Q8CIC2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nupl2Q8CIC2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms